目前在我國，生鮮電商冷鏈物流發展中還存在諸多問題，主要有以下三個方面。

1.物流基礎設施差

我國生鮮電商冷鏈物流發展的一大痼疾是基礎設施差。一是冷庫水平低。當前國內大多數城市冷庫都是20世紀50~80 年代建造的，由于當時的科學技術比較落后，因此不能滿足現代物流的要求。同時很多庫房的衛生條件未能達到標準，不具備先進的裝配設施，滿足不了現今快速發展的需要。二是冷庫結構不夠合理。肉類冷庫過多，果蔬類冷庫過少；城市冷庫過多，農村冷庫過少；經營性冷庫過多，加工類冷庫過少；東部冷庫過多，西部冷庫過少等。三是冷藏保溫車狀況不容樂觀。生鮮電商物品單筆訂單小，區域分散的特點，對倉儲、運輸的要求也就比較高。但我國許多生鮮產品都是常溫配送，缺乏冷藏保溫汽車?，F在我國冷鏈物流中流通的冷藏車，很多都是來自即將淘汰和已經報廢的海運冷藏集裝箱，缺少專業化的冷藏車。冷藏保溫車數量占運輸車輛總數量的0.3%，且車輛制冷技術落后，缺乏規范的運輸車廂和溫度控制設備，易腐性的生鮮食品的質量在運輸過程中得不到保證。在未使用冷鏈物流運輸的情況下，生鮮物品的新鮮度便得不到保障?，F有薄弱的冷鏈技術導致生鮮食品在儲運和配送等過程中易被二次污染，造成巨大的損耗。正因為物流基礎設施差，導致生鮮電商的健康發展受到影響。我國冷鏈物流調查報告顯示，我國4000 多家生鮮電商中，95% 的生鮮電商是無法盈利的。絕大部分不能盈利的原因出在冷鏈運輸上，冷鏈成本占到生鮮電商總成本的40%，而銷售額占比為25%~40%，遠高于其他普通產品的物流運輸費用。

2.物流法規制度缺失

生鮮產品保質期短，容易出現腐爛變質等質量問題。這可以歸咎于電商，但更多是在物流運輸環節。電商環節（出貨時）出現質量問題在我國是有據可依的，通常商家也愿意包攬全責。但是在物流環節出現質量問題則比較棘手，這是因為中間沒有明確的責任界限。因此，《中華人民共和國電子商務法》在生鮮電商領域需要不斷完善，當出現產品質量問題，需要第三方進行監管并做責任鑒定，否則，生鮮電商的運營始終難以實現規范化，最終只能讓商家和消費者都“敬而遠之”。但是，目前我國冷鏈物流領域缺乏具有廣泛約束力的、統一的、可供參考與執行的標準，既沒有制定生鮮食品的物流“門檻”，又沒有一套生鮮食品運輸溫度控制標準，已經嚴重阻礙了我國冷鏈物流業的發展。雖然我國冷鏈物流標準達200 多項，但是這些物流標準并不是法定性標準，操作較為困難。

3.第三方冷鏈物流不完善

第三方冷鏈物流是指在食品冷鏈運輸環節中，為了降低物流成本，企業在運營環節中將冷鏈運輸部分外包給第三方物流公司，由專業的第三方全程來做冷鏈物流。隨著生鮮電商的蓬勃發展，冷鏈物流行業也隨之發展，應運而生的第三方冷鏈物流滿足了行業的需求。但第三方冷鏈物流也存在一些“瓶頸”。

其一，第三方冷鏈物流整體較弱。我國第三方物流企業處于起步狀態，在服務質量、配送速度，配送質量等方面，尚不能滿足自有的業務量，更不能滿足現有的生鮮電商的冷鏈需求。能夠提供綜合性、專業性全程監控服務的第三方冷鏈物流企業寥寥無幾，無法滿足當前廣闊的市場需求。根據對我國物資儲運協會內200 多家物流服務企業的調查結果，我國第三方物流企業能提供的綜合性全程服務還不足總體需求的5%。

其二，第三方冷鏈物流區域分布不均衡。第三方冷鏈物流服務主要集中在我國中南、華東、華北等地，對于西部、西南等地，因地勢險峻、交通不發達、人口分散以及網絡購物意識弱等問題而不得不增加物流成本，因此第三方冷鏈物流配送服務多集中在就近的產地及消費地，而不是偏遠地區。物流市場的分散性導致了第三方物流企業不能提供全國范圍的冷鏈物流服務，也享受不到規模效益帶來的益處。